convert input.png -crop 640x480+40+30 output.png
640x480+40+30の部分は [width]x[height][left][top]
left, topは+10や-90など指定できる。
はみ出した部分の背景色は参考ページだとgifで黒くなっていた。他のオプションで背景色を指定できそう。
参考
Cutting and Bordering -- IM v6 Examples
おまけ
上記ページに載っているが、identifyコマンドで、どこをクロップしたか探せる模様。
identify input.png output.png
